V t.i. neevropskih zbirkah SEM, ki so jih v muzej prinesli številni zbiralci (misionarji, popotniki, mornarji, diplomati, trgovci, študenti) pa razstavljamo predmete nilotskih ljudstev, ki jih je zbral Ignacij Knoblehar (sulice, ščit, stolčka). Zbirko Paula Schebesta pa predstavljamo s predmeti Pigmejcev (košara, čepica s perjem), severni Togo predstavljamo z zbirko Antona Codellija, zahodnoafriške predmete z zbirko Antona Petkovška (maske). Kulturo Otavancev in Očipva pa predstavljamo s predmeti misionarja Friderika Ireneja Barage (pipa, puščice, mokasini, krplje). Zbirko paragvajskih Indijancev predstavljamo z šamanskimi kraguljči, kozmično aro, žensko obredno ogrlico).